Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Sft2d3Q9CSV6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Sft2d3Q9CSV6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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