Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR52

4933400A11Rik, RIKEN cDNA 4933400A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933400A11RikQ9CR52 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933400A11RikQ9CR52 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms