Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ1

Hsbp1, Heat shock factor-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsbp1Q9CQZ1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hsbp1Q9CQZ1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hsbp1Q9CQZ1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms