Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg12Q9CQY1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms