Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccer1Q9CQL2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms