Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nudt21Q9CQF3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nudt21Q9CQF3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nudt21Q9CQF3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudt21Q9CQF3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudt21Q9CQF3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudt21Q9CQF3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudt21Q9CQF3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudt21Q9CQF3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudt21Q9CQF3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudt21Q9CQF3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudt21Q9CQF3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudt21Q9CQF3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudt21Q9CQF3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudt21Q9CQF3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nudt21Q9CQF3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nudt21Q9CQF3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nudt21Q9CQF3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nudt21Q9CQF3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nudt21Q9CQF3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nudt21Q9CQF3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nudt21Q9CQF3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nudt21Q9CQF3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nudt21Q9CQF3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nudt21Q9CQF3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nudt21Q9CQF3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nudt21Q9CQF3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nudt21Q9CQF3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms