Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp2Q9CQ73 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkp2Q9CQ73 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms