Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Pole4Q9CQ36 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pole4Q9CQ36 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pole4Q9CQ36 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pole4Q9CQ36 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pole4Q9CQ36 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pole4Q9CQ36 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pole4Q9CQ36 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pole4Q9CQ36 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pole4Q9CQ36 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms