Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms