Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms