Protein–RNA interactions for Protein: Q99PP6

Trim34a, Tripartite motif-containing protein 34A, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim34aQ99PP6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim34aQ99PP6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim34aQ99PP6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms