Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms