Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep41Q99NF3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms