Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NsmfQ99NF2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms