Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rnf17Q99MV7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms