Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
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