Protein–RNA interactions for Protein: Q99ML1

Bbc3, Bcl-2-binding component 3, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbc3Q99ML1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bbc3Q99ML1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bbc3Q99ML1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bbc3Q99ML1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bbc3Q99ML1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms