Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tnpo2Q99LG2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms