Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms