Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms