Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TrabdQ99JY4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TrabdQ99JY4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TrabdQ99JY4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TrabdQ99JY4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TrabdQ99JY4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TrabdQ99JY4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TrabdQ99JY4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TrabdQ99JY4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TrabdQ99JY4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TrabdQ99JY4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TrabdQ99JY4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrabdQ99JY4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrabdQ99JY4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrabdQ99JY4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrabdQ99JY4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrabdQ99JY4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TrabdQ99JY4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrabdQ99JY4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrabdQ99JY4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrabdQ99JY4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrabdQ99JY4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrabdQ99JY4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrabdQ99JY4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrabdQ99JY4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrabdQ99JY4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrabdQ99JY4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms