Protein–RNA interactions for Protein: Q925N1

Sfxn4, Sideroflexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn4Q925N1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sfxn4Q925N1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Sfxn4Q925N1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfxn4Q925N1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfxn4Q925N1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfxn4Q925N1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Sfxn4Q925N1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Sfxn4Q925N1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfxn4Q925N1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfxn4Q925N1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfxn4Q925N1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Sfxn4Q925N1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Sfxn4Q925N1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Sfxn4Q925N1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Sfxn4Q925N1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Sfxn4Q925N1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Sfxn4Q925N1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Sfxn4Q925N1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Sfxn4Q925N1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Sfxn4Q925N1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Sfxn4Q925N1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfxn4Q925N1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfxn4Q925N1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfxn4Q925N1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfxn4Q925N1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfxn4Q925N1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfxn4Q925N1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfxn4Q925N1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfxn4Q925N1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfxn4Q925N1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfxn4Q925N1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfxn4Q925N1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfxn4Q925N1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfxn4Q925N1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfxn4Q925N1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfxn4Q925N1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Sfxn4Q925N1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfxn4Q925N1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfxn4Q925N1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfxn4Q925N1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfxn4Q925N1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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