Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Rnf144aQ925F3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnf144aQ925F3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf144aQ925F3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
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