Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spdl1Q923A2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spdl1Q923A2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms