Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms