Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sf3b3Q921M3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sf3b3Q921M3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms