Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Odf3Q920N1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms