Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc5a4bQ91ZP4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms