Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cts3Q91ZD5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cts3Q91ZD5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms