Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms