Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klc3Q91W40 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klc3Q91W40 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms