Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn8Q91VA3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.7 ms