Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIG1

Rest, RE1-silencing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RestQ8VIG1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RestQ8VIG1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RestQ8VIG1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RestQ8VIG1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RestQ8VIG1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RestQ8VIG1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RestQ8VIG1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RestQ8VIG1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RestQ8VIG1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RestQ8VIG1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RestQ8VIG1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RestQ8VIG1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RestQ8VIG1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RestQ8VIG1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RestQ8VIG1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RestQ8VIG1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RestQ8VIG1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RestQ8VIG1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RestQ8VIG1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RestQ8VIG1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RestQ8VIG1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RestQ8VIG1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RestQ8VIG1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RestQ8VIG1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RestQ8VIG1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RestQ8VIG1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RestQ8VIG1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RestQ8VIG1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RestQ8VIG1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RestQ8VIG1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RestQ8VIG1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RestQ8VIG1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RestQ8VIG1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RestQ8VIG1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RestQ8VIG1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RestQ8VIG1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RestQ8VIG1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RestQ8VIG1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms