Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cabp4Q8VHC5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cabp4Q8VHC5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 300.8 ms