Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps4aQ8VEJ9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms