Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnajc28Q8VCE1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnajc28Q8VCE1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnajc28Q8VCE1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnajc28Q8VCE1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnajc28Q8VCE1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnajc28Q8VCE1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnajc28Q8VCE1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnajc28Q8VCE1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnajc28Q8VCE1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnajc28Q8VCE1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnajc28Q8VCE1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnajc28Q8VCE1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnajc28Q8VCE1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnajc28Q8VCE1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnajc28Q8VCE1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnajc28Q8VCE1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnajc28Q8VCE1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnajc28Q8VCE1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnajc28Q8VCE1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnajc28Q8VCE1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnajc28Q8VCE1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnajc28Q8VCE1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnajc28Q8VCE1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnajc28Q8VCE1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnajc28Q8VCE1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnajc28Q8VCE1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnajc28Q8VCE1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnajc28Q8VCE1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnajc28Q8VCE1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnajc28Q8VCE1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnajc28Q8VCE1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnajc28Q8VCE1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnajc28Q8VCE1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dnajc28Q8VCE1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms