Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms