Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Colec12Q8K4Q8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Colec12Q8K4Q8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Colec12Q8K4Q8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Colec12Q8K4Q8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Colec12Q8K4Q8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Colec12Q8K4Q8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Colec12Q8K4Q8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Colec12Q8K4Q8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Colec12Q8K4Q8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Colec12Q8K4Q8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Colec12Q8K4Q8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Colec12Q8K4Q8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Colec12Q8K4Q8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Colec12Q8K4Q8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Colec12Q8K4Q8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Colec12Q8K4Q8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Colec12Q8K4Q8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Colec12Q8K4Q8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Colec12Q8K4Q8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Colec12Q8K4Q8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms