Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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