Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl47Q8K2Y7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl47Q8K2Y7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl47Q8K2Y7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl47Q8K2Y7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms