Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W3

Txndc11, Thioredoxin domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc11Q8K2W3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Txndc11Q8K2W3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Txndc11Q8K2W3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Txndc11Q8K2W3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Txndc11Q8K2W3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Txndc11Q8K2W3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Txndc11Q8K2W3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Txndc11Q8K2W3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Txndc11Q8K2W3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Txndc11Q8K2W3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Txndc11Q8K2W3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms