Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc12Q8K2L8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc12Q8K2L8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms