Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Depp1Q8K2F3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Depp1Q8K2F3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Depp1Q8K2F3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Depp1Q8K2F3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Depp1Q8K2F3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Depp1Q8K2F3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Depp1Q8K2F3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Depp1Q8K2F3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Depp1Q8K2F3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Depp1Q8K2F3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Depp1Q8K2F3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Depp1Q8K2F3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Depp1Q8K2F3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Depp1Q8K2F3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Depp1Q8K2F3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Depp1Q8K2F3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Depp1Q8K2F3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Depp1Q8K2F3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Depp1Q8K2F3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Depp1Q8K2F3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Depp1Q8K2F3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Depp1Q8K2F3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Depp1Q8K2F3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms