Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms