Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcf3Q8K268 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 441 ms