Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S6

Spire2, Protein spire homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire2Q8K1S6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spire2Q8K1S6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spire2Q8K1S6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Spire2Q8K1S6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spire2Q8K1S6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spire2Q8K1S6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Spire2Q8K1S6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spire2Q8K1S6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spire2Q8K1S6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spire2Q8K1S6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spire2Q8K1S6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spire2Q8K1S6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spire2Q8K1S6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spire2Q8K1S6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spire2Q8K1S6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spire2Q8K1S6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms