Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LgsnQ8CIX8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms