Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CopaQ8CIE6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CopaQ8CIE6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CopaQ8CIE6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CopaQ8CIE6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CopaQ8CIE6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CopaQ8CIE6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CopaQ8CIE6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CopaQ8CIE6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CopaQ8CIE6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CopaQ8CIE6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CopaQ8CIE6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CopaQ8CIE6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CopaQ8CIE6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CopaQ8CIE6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms