Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NgefQ8CHT1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NgefQ8CHT1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NgefQ8CHT1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NgefQ8CHT1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NgefQ8CHT1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NgefQ8CHT1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NgefQ8CHT1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NgefQ8CHT1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NgefQ8CHT1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NgefQ8CHT1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NgefQ8CHT1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NgefQ8CHT1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NgefQ8CHT1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NgefQ8CHT1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NgefQ8CHT1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NgefQ8CHT1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NgefQ8CHT1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NgefQ8CHT1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NgefQ8CHT1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NgefQ8CHT1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NgefQ8CHT1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NgefQ8CHT1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NgefQ8CHT1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NgefQ8CHT1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NgefQ8CHT1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NgefQ8CHT1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NgefQ8CHT1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NgefQ8CHT1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NgefQ8CHT1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NgefQ8CHT1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NgefQ8CHT1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NgefQ8CHT1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NgefQ8CHT1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NgefQ8CHT1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NgefQ8CHT1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NgefQ8CHT1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NgefQ8CHT1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NgefQ8CHT1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NgefQ8CHT1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NgefQ8CHT1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms