Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms